Lorsque les temps du paganisme sont passés, lorsque le christianisme a cessé d'être persécuté et a été reconnu comme une religion mondiale, il semblerait que toutes les différences devraient être résolues. Mais parfois, seuls les conciles œcuméniques pouvaient résoudre les conflits émergents, réfuter les enseignements hérétiques - il n'y avait pas de paix même au sein de l'Église.
Le premier concile œcuménique fut le concile de Nicée, convoqué en 325. La raison en était l'enseignement répandu du prêtre alexandrin Arius. Son essence était de nier l'identité entre Dieu le Père et Dieu le Fils. Il a soutenu que Jésus-Christ a été créé par le Seigneur, mais n'est pas son incarnation. Une telle idée a fondamentalement réfuté tous les dogmes du christianisme, et donc initialement l'enseignement d'Arius a été rejeté par le Conseil local. Cependant, le fier prêtre a refusé de reconnaître la décision du Concile comme légitime et a continué à gagner les fidèles.
Ensuite, l'empereur Constantin a invité des évêques du monde entier au Concile œcuménique dans la petite ville de Nicée (maintenant appelée Iznik et située sur le territoire de la Turquie moderne). Certains des représentants de l'Église présents portaient des traces de torture sur leur corps,reçu au nom du vrai christianisme. Les évêques soutenant Arius étaient également présents.
Le débat a duré plus de deux mois. Pendant ce temps, il y a eu de nombreuses discussions, des discours de philosophes, des clarifications de formulations théologiques. Comme le raconte la légende, la manifestation d'un miracle divin mit fin aux querelles. Comme unité de trois principes, il a donné l'exemple d'un éclat d'argile: l'eau, le feu, l'argile donnent un tout unique. De même, la Sainte Trinité est essentiellement un seul Dieu. Après son discours, du feu est sorti du tesson, de l'eau est apparue et de l'argile s'est formée. Après un tel miracle, le Concile de Nicée a finalement rejeté le faux enseignement d'Arius, l'a excommunié de l'Église, a approuvé le Credo et a établi 20 règles de discipline de l'Église, a déterminé la date de la célébration de Pâques.
Mais ce Conseil de l'Église n'a pas mis fin à ce problème. La polémique a duré très longtemps. Même maintenant, leurs échos se font encore entendre - l'arianisme a formé la base des enseignements des Témoins de Jéhovah.
En plus du Concile de 325, il y eut aussi le Second Concile de Nicée, convoqué par l'impératrice Irène de Constantinople en 787. Son but était d'abolir l'iconoclasme qui existait à cette époque. En fait, l'impératrice fit deux tentatives pour convoquer un concile œcuménique. Mais en 786, les gardes soutenant les iconoclastes font irruption dans le Temple des Saints Apôtres à Constantinople, où le Concile commence ses travaux. Les saints pères ont dû se disperser.
Après avoir recouru à des ruses considérables, dissolvant la vieille garde, recrutant de nouvelles troupes, Irina convoqua néanmoins la cathédrale en787, mais l'a déplacé de Constantinople à Nicée. Son travail a duré un mois, suite à ses résultats, la vénération des icônes a été restaurée, elles ont été autorisées dans les églises.
Cependant, même ce Concile de Nicée n'a pas pleinement atteint son objectif. L'iconoclasme a continué d'exister. Le mouvement iconoclaste ne fut finalement vaincu qu'en 843, au Concile de Constantinople.